Títulos de divinidad (Dios para Pain y Ángel para Konan).

Amigos de la infancia.

Objetivos: Babosa de Seis Colas (Sellado y capturado por Pain en el anime), Zorro de Nueve Colas (Fallado).

Un equipo que se lleva muy bien el uno con el otro integrante. Esto se nota porque Konan es el único miembro que dice el nombre de Pain. Como el líder de Akatsuki, Pain dirige el resto de la organización a sus metas respectivas, su interacción más directa con la organización es usar la Técnica de sellado: Sello Completo de Nueve Dragones Ilusorios. Pain es el líder de la Aldea Oculta de la Lluvia, y ostenta un título de dios de parte de los aldeanos. Konan tiene el título del "Ángel de Dios" ya que hace trabajos de parte de Pain, y se podría considerar la co-líder de dicha aldea. Tras la muerte de Pain y el abandono de Akatsuki por parte de Konan el equipo se disolvió. Ahora, se asume que Konan es la líder de la aldea de la lluvia, pues ofreció a Naruto Uzumaki todo el apoyo de esta. Actualmente Konan murió a manos de Tobi.

Modificación de cuerpo para la juventud eterna (Jutsu de Inmortalidad para Orochimaru y Marionetas Humanas para Sasori).

Ambos se quedaron huérfanos de niños, de padres asesinados en la Guerra.

Abandonaron sus respectivas aldeas y mataron a los Terceros Kages de éstas; Sasori al Tercer Kazekage y Orochimaru al Tercer Hokage (Hiruzen Sarutobi).

Relacionados con animales venenosos (Serpiente para ;Orochimaru y Escorpión para Sasori).

Tienen apodos ("Orochimaru, la Serpiente Blanca" y Sasori "Escorpión de la Arena Roja").

Ambos pelearon y fueron derrotados por dos miembros del Equipo 7; *Orochimaru por Sasuke y Sasori por Sakura.

Objetivos: Caballo Delfín de Cinco Colas (sellado).

Según Sasori, él y Orochimaru trabajaban bien como un equipo, pero desde que Orochimaru abandonó Akatsuki al no poder robar el cuerpo de Itachi Uchiha, Sasori empezó a tener rencor contra su ex-compañero. Varios años después ambos morirían; Sasori murió en batalla a manos de Chiyo y Sakura Haruno, mientras que Orochimaru fue atrapado en un genjutsu eterno por Itachi Uchiha que uso a Susanoo para atraparlo, aunque después se liberó.

Usuarios de elementos (Fuego para Itachi y Agua para Kisame Hoshigaki).

Ambos poseen como segundo elemento el que le tiene ventaja al principal, Agua para Itachi y tierra para Kisame (aunque ambos solo utilizaron un jutsu de esta categoria hasta el momento).

Nombres de animales ("Comadreja" para Itachi y "Tiburón" para Kisame Hoshigaki).

Apellidos, algo que los demás miembros no tienen (Itachi Uchiha y Kisame Hoshigaki).

Objetivos: Zorro de Nueve Colas (Fracasó), Mono de Cuatro Colas (Sellado).

Era un dúo que trabajaba bien, entre los dos integrantes y era efectivo; esto se debe a sus buenas relaciones y el hecho de que se complementan como opuestos; es decir, Itachi es un experto en jutsus de Fuego y Kisame Hoshigaki en Técnicas de Agua, Itachi es muy rápido y talentoso en Genjutsu, Kisame Hoshigaki en fuerza bruta; en esencia son opuestos. Al serlo son, al parecer, casi invencibles. En lo que concierne a las misiones, este equipo cumplía casi todas las misiones encargadas por Pain sin ninguna dificultad, siendo la captura del Kyūbi la única excepción, debido a la aparición de Jiraya. Itachi y Kisame se llevaban bien el uno con el otro, casi sin conflictos entre ellos; Kisame hacía todo lo que Itachi le pedía sin dudar, y hablaban amistosamente cuando no entraban en combate. Este equipo se separó después de que Itachi muriera a manos de Sasuke Uchiha. En la batalla contra Killer Bee, Kisame es traicionado por su espada Samaheda (lo traiciona por que le gustó mucho el chakra que absorbió del Hachibi) y es decapitado por el Raikage y Killer Bee pero luego se descubre que todo es un plan de Tobi. Kisame fingió su muerte para poder intentar capturar a Naruto por su propia cuenta al intercambiar posiciones con un clon de Zetsu y luego camuflarse dentro de Samehada para así pasar desapercibido, pero luego de que Naruto terminara su entrenamiento, éste lo descubre gracias a sus nuevas habilidades. Maito Gai se enfrenta con Kisame pero en la pelea, éste pierde y sabiendo que las intenciones de los ninjas de Konoha es averiguar todo lo que él sabe sobre Tobi (el supuesto Madara) y Akatsuki, invoca unos tiburones dentro de una prisión de agua que él mismo creó para que estos lo asesinaran. No sin antes asegurar que lo que ha visto, llegue a manos de Tobi.

Valores artísticos (Marionetas Humanas para Sasori y Arcilla Explosiva para Deidara).

Ambos decidieron morir por su cuenta (Sasori no quiso esquivar el ataque de Chiyo, mientras que Deidara se autodestruye).

Ambos en algún punto pelearon con ancianos que fueron sus maestros, (Sasori contra Chiyo y Deidara contra Onoki).

Objetivos: Shukaku de Una Cola (Sellado), Zorro de Nueve Colas (Fracasó).

Un equipo formado por los dos artistas de Akatsuki, Sasori y Deidara, fueron un buen equipo en muchas ocasiones, a pesar de discutir continuamente acerca del concepto del arte. Sasori pensó que todo buen arte debía ser permanente (como sus marionetas), mientras que Deidara tenía una idea de que el mejor arte era efímero (como su arcilla explosiva). Con todo, eran un dúo muy compenetrado entre sí. Sasori tenía muchos contactos y logró establecer a un espía en la Aldea Oculta de la Arena varios años antes de que este equipo llegara para bajar las defensas de la aldea y lograr invadirla. El equipo tuvo varios argumentos y discusiones en planes; Sasori era impaciente y quería acabar las misiones lo más rápido posible, aunque esto se compensa cuando Deidara ejecuta esos planes efectivamente; como lo que hizo en su batalla contra Gaara. Sasori murió en manos de su abuela Chiyo, dejando a Deidara con Tobi (el miembro que suplemento a Sasori). Deidara se autodestruye en la batalla contra Sasuke Uchiha, intentando matar a este para que no se enfrentará contra Itachi Uchiha.

Inmortalidad relativa (Múltiples corazones para Kakuzu y el Jutsu de Inmortalidad de Jashin para Hidan).

Violencia y asesinatos que tuvieron que ver con las respectivas huidas de sus aldeas.

Odio por los ideales de cada uno.

Matan para mantener su invencibilidad (Kakuzu roba corazones y Hidan mantiene su inmortalidad así).

Primer kanji del nombre asociado con el Shogi ("Kakugyo", el obispo para Kakuzu y "Hisha", la torre para Hidan).

Las aldeas de donde provienen están relacionadas con el Elemento Agua: Aldea de la Cascada (Kakuzu) y Aldea de las Aguas Termales (Hidan).

Objetivos: Gato de Dos Colas (sellado), Zorro de Nueve Colas (fracasó).

Otras misiones: Captura de Chiriku (capturado), Captura del cadáver de Asuma (fracasó) y transacciones.

Un equipo muy efectivo, aunque demasiado revoltoso, estaban normalmente haciendo trabajos que no tenían nada que ver con Akatsuki y siempre llegando tarde a las misiones y reuniones de Akatsuki. Pain decidió poner a estos dos juntos por sus habilidades únicas. Hidan, como resultado de "un experimento de la secta de Jashin", no puede ser asesinado aunque le decapiten y Kakuzu puede entrar en un estado de ira y puede matar a quién se le cruce en el camino, incluyendo su compañero. Por lo tanto, con Hidan, Kakuzu puede enfurecerse y no tendría que preocuparse por buscar un nuevo compañero más tarde. Ellos han mostrado la mayor mala sangre entre un dúo de Akatsuki: Kakuzu ve a los rituales y la religión de Hidan como una pérdida de tiempo, y Hidan ve a la disposición de Kakuzu para hacer cosas blasfemas y su codicia como algo insoportable, sin mencionar que el trabajo de caza-recompensas de Kakuzu normalmente vuelve loco a Hidan. Su equipo fue asignado para capturar al Nibi, pero luego decidieron capturar a otro objetivo. Como estuvieron cerca del País del Fuego después de capturar a Yugito Nii; tras sellar a la Bestia de Dos, decidieron perseguir al Kyūbi. Kakuzu murió y Hidan fue permanentemente discapacitado en el País de Fuego, disolviendo al equipo.

Ambos prefieren ocultar su ojo izquierdo (Deidara con su cabello y su monóculo telescópico, y Obito con su máscara).

Ambos entraron a la organización de manera distinta a la de los demás (Deidara obligado y Obito de relleno).

Objetivos: Tortuga de Tres Colas (sellado), Zorro de Nueve Colas (Fracaso).

Otras misiones: Muerte de Sasuke Uchiha (fracasó).

Un equipo formado tras la muerte de Sasori. Obito mejor conocido como Tobi porque ocultaba su identidad con su mascara, fue presentado como un reemplazó fácilmente encontrado. A pesar del entusiasmo de Obito para complacer a su "senpai", su actitud infantil fue vista como una molestia a las expectativas de Deidara de la organización por lo tanto tienen en ocasiones ciertas discusiones chistosas que hacen enfadar a Deidara. Aparte de eso, los dos trabajaban bien juntos, con Obito plantando la arcilla explosiva bajo tierra durante las peleas, aunque más adelante se descubrió que Obito nunca tuvo ningún interés en ayudar a Deidara a vencer a Sasuke. Cuando Deidara estaba a punto de autodestruirse para matar a Sasuke Uchiha, se disculpó con Obito, diciendo que él también podría recibir el radio de la explosión.

Objetivos: Zorro de Nueve Colas (fracasó, denegado por el líder de la organización).

Otras misiones: Devorar Cadáveres, Espionaje, Irrumpir en la cumbre de los 5 Kages y darles información sobre Sasuke (Completada), Hacer un clon de Kisame para ayudarlo en la captura del Hachibi (Completada).

Apodo: Hombre Áloe (Por Naruto).

Objetivos: Escarabajo Rinoceronte de Siete Colas (sellado).

No es un equipo real, pero Zetsu posee dos personalidades que conversan y hasta no se ponen de acuerdo una con la otra. Pueden dividirse para que de este modo puedan hacer dos actividades distintas. Es el encargado de realizar las actividades de espionaje de la organización y devora los cuerpos de los miembros muertos.

Deseo de destruir la Aldea Oculta de la Hoja.

Relación con los laboratorios de Orochimaru.

Ninjas con habilidades únicas, Jugo era el creador de los sellos malditos, Suigetsu la espada Kubikiribōchō, Karin con su Kagura Shingan y la Mordida de la cura y Sasuke como miembro del Clan Uchiha y su gran poder del Sharingan.

Objetivos: Buey de Ocho Colas (fracasó).

Otras misiones: Matar a Danzo e interrumpir en la Reunión de los Kages (Completada)
Como Akatsuki perdió cinco miembros, ya no tienen la fuerza que tuvieron en un principio, para compensar las pérdidas el supuesto Madara ofreció a Taka el poder de los Bijū a cambio de su lealtad y ayudarlos en la destrucción de la Aldea de la Hoja. Para cumplir sus metas, Tobi le encargó a Taka capturar al Hachibi, mientras que Akatsuki capturaba al Kyūbi. Técnicamente, los miembros de Taka no son miembros completos de Akatsuki ya que no llevan los anillos oficiales de la organización, ya que solo están por interés en Akatsuki. El superior del grupo abandonó a sus compañeros disolviendo Taka.